E
- (Upper Bavaria) Emmerting
- (Upper Bavaria) Ettenberg
- (Lower Bavaria) Engersdorf
- (Swabia) Erlachhöfe
- (Lower Bavaria) Eitzingerreut
- (Upper Palatinate) Entermainsbach
- (Upper Bavaria) Elperting
- (Swabia) Ebratshofen
- (Lower Bavaria) Etzenhausen
- (Upper Bavaria) Elkofen
- (Upper Palatinate) Eckenricht
- (Lower Bavaria) Enzersdorf
- (Upper Bavaria) Erlham
- (Lower Bavaria) Eiselsdorf
- (Regierungsbezirk Mittelfranken) Ezelsdorf
- (Regierungsbezirk Mittelfranken) Ezelheim
- (Regierungsbezirk Mittelfranken) Eysölden
- (Upper Bavaria) Eyrain
- (Regierungsbezirk Unterfranken) Eyershausen
- (Regierungsbezirk Mittelfranken) Eyerlohe
- (Swabia) Eyenbach
- (Regierungsbezirk Mittelfranken) Eybburg
- (Regierungsbezirk Mittelfranken) Eyb
- (Upper Bavaria) Eyach
- (Lower Bavaria) Exing
- (Lower Bavaria) Exenbach
- (Lower Bavaria) Exenbach
- (Upper Bavaria) Evenhausen
- (Lower Bavaria) Euzersdorf
- (Upper Palatinate) Eutenhofen