S
- (Haapsalu linn) Sepa
- (Haapsalu linn) Sassi
- (Lääne-Nigula vald) Sealepa
- (Lääne-Nigula vald) Suure-Änniste
- (Lääne-Nigula vald) Saksapalu
- (Lääne-Nigula vald) Söderby
- (Lääne-Nigula vald) Spithami
- (Haapsalu linn) Suurrahu
- (Lääne-Nigula vald) Soolu
- (Lääne-Nigula vald) Salajõe
- (Haapsalu linn) Saanika
- (Haapsalu linn) Saardu
- (Lääne-Nigula vald) Saare
- (Vormsi vald) Saxby
- (Lääne-Nigula vald) Saunja
- (Lääne-Nigula vald) Seljaküla
- (Lääne-Nigula vald) Silla
- (Haapsalu linn) Sinalepa
- (Vormsi vald) Söderby
- (Haapsalu linn) Sõmeri
- (Lääne-Nigula vald) Soo-otsa
- (Lääne-Nigula vald) Soovälja
- (Haapsalu linn) Sündeva
- (Haapsalu linn) Suur-Ahli
- (Vormsi vald) Suuremõisa
- (Lääne-Nigula vald) Suure-Rõude
- (Lääne-Nigula vald) Suur-Kalju
- (Lääne-Nigula vald) Suure-Lähtru
- (Lääne-Nigula vald) Suur-Nõmmküla
- (Haapsalu linn) Suure-Pusku