S
- (Luunja vald) Sooranna
- (Elva vald) Sangla
- (Nõo vald) Sassi
- (Kambja vald) Sulu
- (Kambja vald) Sirvaku
- (Peipsiääre vald) Sookalduse
- (Luunja vald) Sirgumetsa
- (Luunja vald) Savikoja
- (Luunja vald) Sääsekõrva
- (Luunja vald) Sääsküla
- (Kambja vald) Sipe
- (Peipsiääre vald) Sõõru
- (Peipsiääre vald) Savka
- (Peipsiääre vald) Sahkri
- (Peipsiääre vald) Särgla
- (Tartu vald) Suuresöödi
- (Tartu linn) Soomeküla
- (Peipsiääre vald) Sookurgu
- (Peipsiääre vald) Saburi
- (Luunja vald) Saeveski
- (Luunja vald) Siugsoo
- (Tartu vald) Saare
- (Peipsiääre vald) Sääritsa
- (Tartu vald) Sooküla
- (Elva vald) Soovaveski
- (Elva vald) Saare
- (Elva vald) Sootla
- (Kambja vald) Simka
- (Tartu vald) Soeküla
- (Elva vald) Suure-Konguta