S
- (Cote d'Or) Santosse
- (Jura) Senaud
- (Cote d'Or) Saint-Anthot
- (Yonne) Saint-Martin-sur-Ocre
- (Cote d'Or) Semond
- (Saône-et-Loire) Saint-Huruge
- (Jura) Sergenon
- (Saône-et-Loire) Saint-Maurice-des-Champs
- (Haute-Saône) Saint-Ferjeux
- (Nièvre) Saint-Franchy
- (Saône-et-Loire) Saint-Martin-la-Patrouille
- (Doubs) Samson
- (Cote d'Or) Sainte-Colombe-en-Auxois
- (Jura) Songeson
- (Doubs) Silley-Bléfond
- (Jura) Saint-Thiébaud
- (Jura) Saugeot
- (Saône-et-Loire) Saint-Privé
- (Cote d'Or) Saint-Jean-de-Bœuf
- (Yonne) Sauvigny-le-Beuréal
- (Cote d'Or) Savilly
- (Jura) Saint-Hymetière
- (Haute-Saône) Saponcourt
- (Nièvre) Saint-Bonnot
- (Cote d'Or) Souhey
- (Saône-et-Loire) Saunières
- (Jura) Séligney
- (Haute-Saône) Saint-Gand
- (Saône-et-Loire) Savianges
- (Yonne) Sennevoy-le-Haut