S
- (Kabupaten Karimun) Sekumbang
- (Kabupaten Karimun) Sungailimau
- (Kabupaten Karimun) Seibuluh
- (Kota Batam) Setengh
- (Kabupaten Karimun) Semamal
- (Kota Batam) Sembulang
- (Kabupaten Lingga) Senayang
- (Kota Batam) Sengkuang
- (Kota Batam) Seranggung
- (Kabupaten Lingga) Serayak
- (Kota Batam) Seribu
- (Kabupaten Natuna) Setedung
- (Kabupaten Lingga) Selayar
- (Kabupaten Lingga) Singkep Island
- (Kota Batam) Sinyantung
- (Kabupaten Karimun) Sugi
- (Kabupaten Bintan) Sumpat
- (Kabupaten Lingga) Sungaiakar
- (Kabupaten Bintan) Sungai Kolak
- (Kabupaten Karimun) Sungaiungar
- (Kabupaten Karimun) Sanglar
- (Kabupaten Karimun) Sandam
- (Kabupaten Karimun) Sungaiasam
- (Kota Batam) Sagulung
- (Kabupaten Natuna) Sahi
- (Kabupaten Lingga) Saisum
- (Kabupaten Karimun) Salemah
- (Kabupaten Lingga) Sambau
- (Kota Batam) Sambu
- (Kabupaten Lingga) Sebetik Kiri