S
- (Raseiniai) Stunguriai
- (Kėdainiai) Stukai
- (Prienai) Strielčiai
- (Kaišiadorys) Strėvininkai
- (Jonava) Strebeikiai
- (Kaišiadorys) Stoniava
- (Raseiniai) Stonai
- (Raseiniai) Steponkaimis
- (Raseiniai) Stenioniai
- (Kėdainiai) Stebuliai
- (Jonava) Stašiūnai
- (Kaišiadorys) Stasiūnai
- (Jonava) Stašėnai
- (Kaunas) Stankūnai
- (Kaunas) Stanaičiai
- (Prienai) Stakliškės
- (Kėdainiai) Stageliai
- (Kaišiadorys) Stabintiškės
- (Kaunas) Stabaunyčius
- (Kėdainiai) Sriubiai
- (Kaunas) Sprindiškės
- (Jonava) Spanėnai
- (Raseiniai) Spandotai
- (Prienai) Sokonys
- (Raseiniai) Sokaičiai
- (Jonava) Sofijauka
- (Prienai) Sobuva