J
- (Okres Tábor) Janov
- (Okres Český Krumlov) Janova Ves
- (Okres České Budějovice) Janovka
- (Okres České Budějovice) Janovka
- (Okres Český Krumlov) Janské Údolí
- (Okres Český Krumlov) Jaroměř
- (Okres České Budějovice) Jaronice
- (Okres Strakonice) Jemnice
- (Okres Prachatice) Jungwirth
- (Okres Český Krumlov) Josefův Důl
- (Okres Jindřichův Hradec) Josefsko
- (Okres Jindřichův Hradec) Josefodol
- (Okres Prachatice) Jodlovy Chalupy
- (Okres Jindřichův Hradec) Jižná
- (Okres Jindřichův Hradec) Jitra
- (Okres České Budějovice) Jiterní Ves
- (Okres Český Krumlov) Jistebník
- (Okres České Budějovice) Jiříkovo Údolí
- (Okres Český Krumlov) Jiřice
- (Okres Strakonice) Jiřetice
- (Okres Strakonice) Jindřichovice
- (Okres Tábor) Jeníčkova Lhota
- (Okres Český Krumlov) Jenín
- (Okres Český Krumlov) Jenišov
- (Okres Český Krumlov) Jermaly
- (Okres Jindřichův Hradec) Jersice
- (Okres Písek) Jestřebice
- (Okres Strakonice) Jetišov
- (Okres České Budějovice) Jeznice
- (Okres Tábor) Jezviny