S
- (Kabupaten Jayapura) Sabrom
- (Kabupaten Biak Numfor) Saukami
- (Kabupaten Biak Numfor) Sopen
- (Kabupaten Biak Numfor) Sinober
- (Kabupaten Biak Numfor) Sarpa
- (Kabupaten Biak Numfor) Serapan
- (Kabupaten Biak Numfor) Samoa
- (Kabupaten Biak Numfor) Son
- (Kabupaten Biak Numfor) Samares
- (Kabupaten Biak Numfor) Sassari
- (Kabupaten Biak Numfor) Samber
- (Kabupaten Jayapura) Sairum
- (Kabupaten Keerom) Samsi
- (Kabupaten Keerom) Sawia
- (Kota Jayapura) Skaumaba
- (Kota Jayapura) Skouyambe
- (Kabupaten Jayapura) Suajaf
- (Kabupaten Jayapura) Swarekas
- (Kabupaten Sarmi) Sabarania
- (Kabupaten Sarmi) Safrontani
- (Kabupaten Jayapura) Sekori
- (Kabupaten Keerom) Sowjo
- (Kabupaten Waropen) Sepaseri
- (Kabupaten Supiori) Sorendidori
- (Kabupaten Keerom) Skofro
- (Kabupaten Keerom) Samna
- (Kabupaten Keerom) Sekanto
- (Kabupaten Jayapura) Saomaikrang
- (Kabupaten Jayapura) Senggerai
- (Kabupaten Jayapura) Sawesuma