D
- (Okres Český Krumlov) Dobechov
- (Okres České Budějovice) Dobčice
- (Okres Písek) Dmýštice
- (Okres Český Krumlov) Dluhoště
- (Okres Prachatice) Dlouhý Bor
- (Okres Strakonice) Dlouhá Ves
- (Okres České Budějovice) Dlouhá Stropnice
- (Okres Český Krumlov) Desky
- (Okres Český Krumlov) Děkanské Skaliny
- (Okres České Budějovice) Dehtáře
- (Okres Písek) Dědovice
- (Okres Tábor) Dědice
- (Okres Tábor) Debrník
- (Okres Jindřichův Hradec) Děbolín
- (Okres České Budějovice) Dasnýy
- (Okres Jindřichův Hradec) Dančovice
- (Okres Český Krumlov) Další Lhota
- (Okres Český Krumlov) Daleké Popelice
- (Okres Prachatice) Dachov
- (Okres Jindřichův Hradec) Dobrohošť
- (Okres Jindřichův Hradec) Drunče
- (Okres Jindřichův Hradec) Dívčí Kopy
- (Okres Prachatice) Dvory
- (Okres Tábor) Dražičky
- (Okres Prachatice) Drslavice
- (Okres Jindřichův Hradec) Dolní Skrýchov
- (Okres Jindřichův Hradec) Doňov
- (Okres Strakonice) Droužetice
- (Okres České Budějovice) Dolní Kněžeklady
- (Okres České Budějovice) Dobšice