- Emilio Hernández
- Emilliano Zapata
- Encarnación
- Encinillas
- Encinillos
- Encino Largo
- Endó
- Epazoyucan
- Epopulco
- Escobal
- Escobillas
- Escondida de lo Verde
- Escondida de San Rafael
- Escuayo
- Espejel
- Espíritu
- Estación de Apulco
- Estación San Vicente
- Estación Tepa
- Estanzuela
- Estanzuela
- Estocuapa (La Colmena)
- Ex- Hacienda de Ocotza
- Ex-Hacienda de Tecajete
- Ex-Hacienda Debodhe
- Ex-Hacienda el Marqués
- Ex-Hacienda Guadalupe Arcos
- Ex-Hacienda Montecillos
- Ex-Hacienda San Antonio Tochatlaco
- Ex-Hacienda San Cayetano