M
- (Okres Český Krumlov) Malý Jindřichov
- (Okres Český Krumlov) Malý Chuchelec
- (Okres Český Krumlov) Malé Strážné
- (Okres Písek) Malé Nepodřice
- (Okres Český Krumlov) Mýto
- (Okres České Budějovice) Mýtiny
- (Okres Český Krumlov) Mýtina
- (Okres Písek) Myšenec
- (Okres Strakonice) Mužetice
- (Okres Jindřichův Hradec) Mutyněves
- (Okres Jindřichův Hradec) Mutná
- (Okres Jindřichův Hradec) Mutišov
- (Okres Tábor) Mutice
- (Okres České Budějovice) Munice
- (Okres České Budějovice) Mühlberg
- (Okres Český Krumlov) Muckov
- (Okres Český Krumlov) Muckenschlag
- (Okres Český Krumlov) Mříč
- (Okres Strakonice) Mračov
- (Okres Tábor) Mozolov
- (Okres Jindřichův Hradec) Mosty
- (Okres Český Krumlov) Mostky
- (Okres Tábor) Mostek
- (Okres Jindřichův Hradec) Mostečný
- (Okres Prachatice) Mošna
- (Okres Český Krumlov) Moravice
- (Okres Tábor) Moraveč
- (Okres Tábor) Moraveč
- (Okres Český Krumlov) Morašov
- (Okres České Budějovice) Mokré